財政部１０５０２２３新聞稿
非屬小規模獨資、合夥組織之營利事業自辦理104年度營利事業所得稅結（決、清）算申報，應以全年度應納稅額的半數，減除尚未抵繳的扣繳稅額，計算應繳的營利事業所得稅，於申報前自行繳納；並以其營利事業所得額減除全年應納稅額半數後的餘額，列為資本主或合夥人個人綜合所得稅的營利所得，申報繳納個人綜合所得稅。
財政部南區國稅局舉例說明，甲獨資商號104年度營利事業所得稅結算申報營利事業課稅所得額100萬元，全年度應納稅額是17萬元（100萬元*稅率17％），扣繳稅額5,000元，則甲獨資商號必須於申報前繳納應繳的營利事業所得稅8萬元（17萬元*50％－5,000元）；而該獨資商號全年所得額減除應納稅額半數後的餘額91.5萬元（100萬元－8.5萬元），為甲資本主的營利所得，甲資本主於申報其104年度綜合所得稅時，一併申報納稅。
該局特別提醒，獨資、合夥組織營利事業階段所繳納的稅額，不可抵繳綜合所得稅。至於規模狹小、交易零星，每月銷售額未達使用統一發票標準的小規模營利事業，則仍維持原本制度課徵綜合所得稅，無須辦理營利事業所得稅結（決、清）算申報。